Gedung Sekolah

Ruang UKS

1. Tempat pemeriksaan kesehatan siswa, termasuk kesehatan gigi.
2. Tempat imunisasi untuk seluruh siswa.
3. Untuk pengobatan pertama bagi siswa yang terluka pada saat kegiatan KBM (Kegiatan Belajar Mengajar).
4. Tempat istirahat sementara bagi siswa yang merasa kurang sehat (pusing, mual, dan lain-lain). 

Laboratorium Sains

1. Tempat melakukan berbagai uji coba/praktik IPA.
2. Ujian praktik siswa kelas VI.
3. Tempat kegiatan Excellent Life Skill Art & Craft

Ruang Komputer

Seiring dengan perkembangan zaman yang terus maju, khususnya di bidang teknologi, Petra yang bergerak di bidang pendidikan turut mengikuti perkembangan tersebut dengan melengkapi fasilitas sekolah berupa iMac, LCD Projector, Air Conditioner dan pembaharuan meja-kursi. Tentu saja tidak hanya sekedar fasilitas yang memadai, namun diikuti juga dengan pembelajaran iOS for iMac (untuk siswa) serta pelatihan dan pembelajaran multimedia (untuk guru). Harapannya, dengan fasilitas  dan pembelajaran baru yang dimiliki, mampu menghasilkan siswa yang cerdas dan kreatif seiring dengan perkembangan teknologi.

Ruang Media

1. Sarana KBM dengan fasilitas AC, komputer + LCD projector, OHP, TV 29", DVD Player, sound system + woofer, dan lemari yang berisi alat peraga matematika, bahasa, PKN, dan IPA.
2. Tempat Excellent Life Skill Biola dan Piano.
3. Presentasi bedah buku.
4. Presentasi hasil studi banding/kunjungan ke luar sekolah.

Ruang Media Interaktif

1. Sarana penunjang KBM dengan fasilitas AC, komputer + LCD projector, OHP, dan beberapa alat peraga sains.
2. Presentasi hasil penelitian siswa.
3. Kegiatan Excellent Life Skill Robotic.

Ruang Paduan Suara dan Kesenian

1. Tempat latihan paduan suara.
2. Tempat latihan gamelan.
3. Tempat latihan seni tari.
4. Tempat kegiatan Excellent Life Skill Bahasa Inggris

Ruang Pamer

1. Menjelaskan tentang sejarah singkat berdirinya PPPK Petra dan SD Kristen Petra 13.
2. Memajang hasil karya siswa dari kelas I—VI.
3. Memajang foto–foto kegiatan dan acara yang ada di SD Kristen Petra 13.
4. Mengadakan pameran hasil karya siswa (origami, puisi, hiasan dinding, dan lain-lain).

Ruang Angklung dan Kolintang

1. Tempat ekstrakurikuler seni angklung dan kolintang.
2. Tempat latihan musik angklung dan kolintang.

Aula

1. Tempat KBM seni tari.
2. Tempat ekstrakurikuler pramuka.
3. Tempat ceramah napza dan seks untuk siswa kelas V - VI.
4. Tempat pertemuan dengan orang tua siswa kelas I - VI.
5. PD siswa setiap hari Sabtu.
6. Tempat untuk merayakan Hari Paskah dan Natal.
7. Tempat kegiatan Pendidikan Karakter.

Ruang Perpustakaan

1. Tempat peminjaman buku bagi seluruh siswa.
2. Penelusuran informasi.
3. Jam pelajaran perpustakaan.
4. Peminjaman peraga IPS, IPA, Matematika.

Ruang BK

1. Ruang untuk berkonsultasi dalam memecahkan suatu masalah, antara guru dengan siswa, dan guru dengan orang tua siswa.
2. Tempat memberikan bimbingan pribadi pada siswa yang bermasalah.

Lapangan Olahraga

1. Sarana olahraga yang luas dan lapang.
2. Tempat bermain yang luas dan menyenangkan.
3. Lapangan upacara.
4. Untuk mengadakan event pertandingan olahraga antarsekolah.
5. Tempat menyelenggarakan pentas seni dan lomba pada hari-hari besar.
6. Tempat pelatihan/persiapan lomba-lomba.

Fitness Center

Merupakan salah satu fasilitas di SD Kristen Petra 13, Guna mennjang kegiatan SLO ( Student Learning Outcomes ) dari segi Physical Growth. Disini kami berusaha untuk menurunkan angka Obesitas / overweight pada siswa yang memiliki berat badan lebih, untuk kembali normal. Pada program ini SD Kristen Petra 13 Menyediakan 2 alat yaitu Treadmill dan Static Bicycle.

Laboratorium Alam

1. Sarana belajar di luar kelas yang menyenangkan.
2. Untuk mengamati tumbuh–tumbuhan pada saat pelajaran IPA.
3. Tempat praktik IPA (mencangkok, setek, dan lain-lain).

Ruang Kelas

1. Tempat untuk kegiatan belajar mengajar.
2. Proses kegiatan belajar Pendidikan Karakter.
3. Dilengkapi dengan fasilitas LCD, Kipas Angin, serta OHP.

Kebun Sekolah

1. Tempat penyaringan air dan tandon air bersih sekolah.
2. Sebagai contoh salah satu bentuk lingkungan buatan.
3. Salah satu contoh bentuk penghijauan di sekolah.

Kamar Mandi

1. Tempat air kecil / BAB bagi para siswa.
2. Tempat untuk mengganti baju seragam olahraga.

Kantin Sekolah

Untuk kantin sekolah seluruh makanan yang disediakan sangat terkontrol, baik secara kebersihan maupun kesehatan (gizi). PPPK Petra selaku induk sekolah petra selalu mengontrol semua makanan yang dijual diseluruh kantin petra. Demi menjaga kesehatan seluruh para siswa.